Trường Trung cấp Bách Khoa Sài Gòn có 7 khoa: Khoa Y, Khoa Dược, Khoa Điều dưỡng - Hộ sinh, Khoa Kinh tế, Khoa Kỹ thuật, Khoa Cơ bản, Khoa Quốc tế với các chương trình đào tạo đa dạng gồm: hệ Đại học, Cao đẳng (liên thông, vừa làm vừa học, từ xa) Trung cấp chuyên nghiệp, và các chương trình hợp tác quốc tế. 
 

Đội ngũ giảng viên của trường tốt nghiệp từ các trường đại học lớn trong nước cũng như nước ngoài, có nhiều kinh nghiệm giảng dạy và chuyên môn cao, với phương thức đào tạo xen kẽ kết hợp với phương pháp giảng dạy hiện đại, chú trọng phát triển khả năng tư duy và kỹ năng nghề nghiệp cho sinh viên.